В структуру отдела входят: 

     Сектор отечественных изданий и изданий на иностранных языках;(2 -4 эт.)

     Сектор работы с коллекционным фондом (2-4 эт.)

     Сектор художественной литературы (3 эт.)

     Отдел хранения фондов как самостоятельное структурное подразделение библиотеки существует с 1935 года. Сначала отдел работал под руководством заведующего отделом абонемента, а с 1936 года – под руководством заведующего отделом хранения. В октябре 2019 сектор художественной литературы перешел в структуру отдела хранения фондов.

В ведении отдела находятся: 
     Основной фонд (русский и иностранный, художественный);
     Фонд карт, нот;

     Фонд микрофильмов.

Основные задачи отдела:
     Обеспечение наиболее рациональной организации хранения основного и коллекционного фонда библиотеки;
     Предоставление изданий из основного фонда для использования в читальных залах, на абонементах, на выставках и обзорах;

     Ведение справочно-библиографического аппарата отдела;
     Обеспечение сохранности фонда;
     Научно-методическая разработка вопросов организации и хранения фондов.