По данным мониторинга деятельности федеральных образовательных учреждений высшего профессионального образования, опубликованного Министерством образования и науки Российской Федерации, НИУ СГУ признан эффективным вузом.

Результаты мониторинга деятельности образовательных учреждений были представлены в отношении 502 государственных вузов и 930 филиалов вузов. Показатели, пороговые значения и критерии, на основе которых проведено выделение образовательных учреждений, имеющих признаки неэффективности, были подготовлены в соответствии с рекомендациями Ассоциации федеральных университетов, национальных исследовательских университетов, Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова и Санкт-Петербургского государственного университета.

Мониторинг вузов Минобрнауки совместно с Рособрнадзором проводило с 15 августа по 15 сентября 2012 года. Учебные заведения предоставили ведомству информацию о своей деятельности по 50 параметрам. Основными критериями стали средний балл ЕГЭ студентов бюджетных и платных отделений, объем НИОКР (научно-исследовательских, опытно-конструкторских и технологических работ) в расчете на одного педагога, доля окончивших вуз иностранных студентов в общем выпуске, доходы учебного заведения в расчете на одного преподавателя, а также общая площадь учебно-лабораторных зданий вуза в расчете на одного студента.

Саратовская область представлена в мониторинге семью вузами и семнадцатью филиалами университетов. Все вузы успешно прошли пороговые значения показателей эффективности, а из 17-ти филиалов четыре признаны неэффективными (Балашовский филиал РАНХиГС, Петровский филиал СГСЭУ, Ртищевский филиал МГУПС, Саратовский филиал РГГУ).