Специальность «Медицинская физика» была открыта по инициативе заведующего кафедрой физики твердого тела Усанова Дмитрия Александровича в 2000 году. В этом же году был проведен набор на специальность «Медицинская физика» на договорной основе. В 2002 году специальность «Медицинская физика» была включена в заявку на тендер и стала ежегодно получать до 10 бюджетных мест.

Первый выпуск специалистов по медицинской физике в СГУ состоялся в 2005 году. Государственная аттестационная комиссия под председательством доктора медицинских наук, проректора по учебной работе Саратовского государственного медицинского университета, профессора Виталия Викторовича Моррисона высоко оценила представленные на защиту дипломные работы.

В этом же году при открытии нового факультета нано- и биомедицинских технологий была создана кафедра медицинской физики, заведующим которой был избран профессор, доктор физико-математических наук, член ассоциации Медицинских физиков России, руководитель Учебно-методического центра непрерывной подготовки СГУ Скрипаль Анатолий Владимирович.

В 2011 году было открыто направление подготовки бакалавров и магистров 011200 «Физика» по профилю и программе  «Медицинская физика». 

Сейчас ведется набор 20 бакалавров и 10 магистратов, а также аспирантов по направлению 03.01.02 «Биофизика».