Органическая химия, биохимия и биотехнология

Не могли бы Вы на основании данных ИК спектроскопии сделать предположение, каким образом удерживается кристаллизационная вода в комлексе (может быть, наблюдаются какие-то сдвиги полос в лигандах у групп, которые, предположительно, отвечают за взаимодействие с молекулами воды)? Есть ли какие-то наблюдения относительно того, в каком комплексе обнаруживается 3 молекулы воды, а в каком - 4 и от чего это может зависеть? Спасибо.

Не могли бы Вы предоставить ссылку на данные РСА выделенного вами фермента в PDB? Интересно ознакомиться с методом кристаллизации данного белка. Спасибо.

Я правильно понял, что вами сделан вывод о согласованном механизме циклоприсоединения на основании строения продуктов реакции (их спектральных характеристик)? Если да, то можно ли предположить строение продуктов в случае несогласованного присоединения, и какие отличия в спектрах таких соединений следует ожидать, чтобы провести однозначное отнесение сигналов и установить механизм? Спасибо.

Есть ли ещё какие-то доводы в пользу большей нуклеофильности атома азота по сравнению с серой? Дело в том, что, согласно концепции ЖМКО, нуклеофильность связывают скорее с "мягкостью", а атом серы вследствие большего радиуса представляется, с позиций концепции Пирсона, более предпочтительным, на первый взгляд. 

Спасибо за интересный материал. Не могли бы Вы указать рассчитанные энергии образования (энтальпии?) фермент-лигандных комплексов для вашего лиганда и препарата сравнения? В каких единицах они рассчитаны?

Депонированы ли кристаллографические данные динитрилов 2 и 4, и есть ли соответствующие публикации с описанием особенностей их строения в кристаллах? Если да, то не могли бы Вы их привести? Спасибо.

С какой целью синтезы на схеме 1 проводились при очень низких температурах? Каким способом это достигалось?

Проводилась ли Вами регистрация и выделение соединений А и В, представленных на рис.1.?

По каким параметрам Вы делаете вывод о большей эффективности ПЭГ-1500 на ряду с краун-эфирами?

На первый взгляд, атомы водорода в, очевидно сокращённой схеме, находятся "вдалеке" от реагирующих центров, что порождает вопрос, относительно механизма перемещения атомов водорода "по" изучаемым вами системам? Является он мономолекулярным, бимолекулярным, либо может быть описан как-то иначе? Есть ли какие-то предположения на этот счёт? Спасибо.

Почему был выбран именно 2,6-дифурилметилиденциклогексанон? Не использовались ли вами диеновые производные циклогексанона с иными заместителями? 

Как вы учитываете, что сигнал протона Н4 для вашего соединения в спектре ЯМР Н1 наблюдается в виде дублета? Если посмотреть на возможные таутомеры полученного соединения, то для структур А и Б протон Н4 в спектре ЯМР Н1 должен присутствовать в виде синглета, в то время как для таутомера В он будет в виде дублета. Можете ли вы тогда на основании вашего спектра сделать вывод об преимущественном образовании соединения со структурой таутомера В?